Package abstrasy.pcfx

Source Code of abstrasy.pcfx.PCFx_mutate

package abstrasy.pcfx;


import abstrasy.Node;

import abstrasy.interpreter.InterpreterException;
import abstrasy.interpreter.StdErrors;

/**
* Abstrasy Interpreter
*
* Copyright : Copyright (c) 2006-2012, Luc Bruninx.
*
* Concédée sous licence EUPL, version 1.1 uniquement (la «Licence»).
*
* Vous ne pouvez utiliser la présente oeuvre que conformément à la Licence.
* Vous pouvez obtenir une copie de la Licence à l’adresse suivante:
*
*   http://www.osor.eu/eupl
*
* Sauf obligation légale ou contractuelle écrite, le logiciel distribué sous
* la Licence est distribué "en l’état", SANS GARANTIES OU CONDITIONS QUELLES
* QU’ELLES SOIENT, expresses ou implicites.
*
* Consultez la Licence pour les autorisations et les restrictions
* linguistiques spécifiques relevant de la Licence.
*
*
* @author Luc Bruninx
* @version 1.0
*/

public class PCFx_mutate extends PCFx {
   
/*****
* Implémente nativement l'algorithme 'simple mutate' où on mute par simple permutation les gènes dont la position
* est dans une liste différentielle.
*****/

   
    public PCFx_mutate() {
    }

    private final static boolean isIn_int(int a, Node liste) throws Exception{
        for(int i=0;i<liste.size();i++){
            Node b = liste.getSubNode(i,Node.TYPE_NUMBER);
            if(a==(int)b.getNumber()){
                return true;
            }
        }
        return false;
    }
   
    private final static void remove_int(int a, Node liste) throws Exception{
        for(int i=0;i<liste.size();i++){
            Node b = liste.getSubNode(i,Node.TYPE_NUMBER);
            if(a==(int)b.getNumber()){
                liste.removeElementAt(i--);
            }
        }
    }
   
    private final static int select_int(int a, Node liste) throws Exception{
        int b=a;
        if(liste.size()>1){
            while(b==a){
                int i = (int)Math.round(Math.random()*(liste.size()-1));
                b = (int)liste.getSubNode(i,Node.TYPE_NUMBER).getNumber();
            }
            return b;
        }
        else{
            return (int) liste.getSubNode(0,Node.TYPE_NUMBER).getNumber();
        }
    }
   
    /**
     * eval
     *
     * @param startAt Node
     * @return Node
     * @throws Exception
     * @todo Implémenter cette méthode abstrasy.PCFx
     */
    public Node eval(Node startAt) throws Exception {
        /*
         * formes: (mutate [liste-génotype] [liste-différentielle])
         */
       
        startAt.isGoodArgsCnt(3);
       
        Node s = startAt.getSubNode(1, Node.TYPE_CLIST);
        Node sdiff = startAt.getSubNode(2, Node.TYPE_CLIST);
        Node r;
   
        if(sdiff.size()<2)
            throw new InterpreterException(StdErrors.extend(StdErrors.Out_of_range,"diff list size < 2"));
       
        // il ne peut pas y avoir 2 x le même...
        Node diff = Node.createCList();
        for(int i=0;i<sdiff.size();i++){
            Node n = sdiff.getSubNode(i,Node.TYPE_NUMBER);
            if(isIn_int((int)n.getNumber(),diff))
                throw new InterpreterException(StdErrors.Duplicate_parameters);
            else
                diff.append(n);
        }
       
        // besoin d'une copie
        Node diff2 = diff.select(0, diff.size());
       
        // résulat...
        r = Node.createCList();
       
        for(int i=0;i<s.size();i++){
            if(isIn_int(i,diff) && (diff2.size()>0)){
                int j = select_int(i,diff2);
                remove_int(j,diff2);
                if(j<0 || j>=s.size()){
                    throw new InterpreterException(StdErrors.Out_of_range);
                }
                r.append(s.elementAt(j).secure());
            }
            else{
                r.append(s.elementAt(i).secure());
            }
        }
      
        return r;

    }

}
TOP

Related Classes of abstrasy.pcfx.PCFx_mutate

TOP
Copyright © 2018 www.massapi.com. All rights reserved.
All source code are property of their respective owners. Java is a trademark of Sun Microsystems, Inc and owned by ORACLE Inc. Contact coftware#gmail.com.