for (File file : files) {
if (file.getName().endsWith(".eqtl")) {
File sortedFile = new File(file.getAbsolutePath() + ".sorted.eqtl");
Sorter sorter = Sorter.getSorter(file, sortedFile);
sorter.run();
(new EqtlPreprocessor()).process(sortedFile.getAbsolutePath(), file.getAbsolutePath() + ".bin");
}
}
}