adremap.put(oldDefinitionId, newDefinitionId);
}
// union annotation values
AnnotationValueTable avt = protoNetwork2.getAnnotationValueTable();
for (TableAnnotationValue av : avt.getAnnotationValues()) {
Integer newDefinitionId =
adremap.get(av.getAnnotationDefinitionId());
protoNetwork1.getAnnotationValueTable().addAnnotationValue(
newDefinitionId, av.getAnnotationValue());