private void convertParsimonyModelSet(
CharacterData pMesqMatrix,
SpecsSetVector pSetVector,
CharacterMatrix pMatrix) {
ParsimonyModelSet defaultModelSet = (ParsimonyModelSet) pMesqMatrix
.getCurrentSpecsSet(ParsimonyModelSet.class);
boolean foundDefault = false;
for (int i = 0; i < pSetVector.size(); i++) {
SpecsSet ss = (SpecsSet) pSetVector.elementAt(i);
if (ss instanceof ParsimonyModelSet) {
ParsimonyModelSet pmSet = (ParsimonyModelSet) ss;
TypeSet typeSet = createTypeSet(pMesqMatrix, pmSet, pMatrix);
if (pmSet == defaultModelSet) {
foundDefault = true;